Após os acontecimentos em Nova York, retratados em Os Vingadores, a S.H.I.E.L.D. (Superintendência Humana de Intervenção, Espionagem, Logística e Dissuasão) se vê obrigada a mobilizar seus integrantes, humanos comuns sem poderes, para solucionar vários casos relacionados com super-heróis. Assim o agente Phil Coulson busca integrar uma equipe eficaz para investigar os segredos estranhos e desconhecidos em um mundo habitado por seres poderosos e alienígenas.